自身免疫病的发病率在全球不断攀升。免疫系统为什么会攻击自身组织呢？原因非常复杂且尚未阐明。
一种原因可能是免疫隔离部位抗原的释放。人的脑、睾丸、晶状体等组织在正常情况下是免疫系统无法进入的特殊部位，不会引起免疫应答。但外伤或感染等可能破坏这种免疫隔离。例如，左眼眼球破裂致晶状体物质进入血液，则可遭遇血液中的免疫细胞，诱导针对晶状体的免疫应答，进而攻击正常右眼，导致交感性眼炎。
另一种原因是相似抗原，例如链球菌和正常肾脏组织具有类似抗原性，当链球菌感染人体而诱导免疫应答时，抗体会错误攻击相似的肾脏组织抗原，导致类风湿肾炎。
还有一种原因是化学物质导致的自身抗原改变。比如，服用某些化学药物可能改变红细胞性质，使机体产生抗红细胞的自身抗体并破坏红细胞而导致贫血。
