据中国科学报10月1日报道 近日,生物学预印本服务器(BioRxiv)在线发表了中国优良地方猪——陆川猪的染色体级别的高质量定相(Phased)基因组序列。这不仅填补了亚洲家猪缺少高质量参考基因组的空白,更为基因组组装提供了新的方向。
该项成果由中国农业科学院深圳农业基因组研究所猪基因组设计育种创新团队主导完成。
项目负责人、基因组所研究员唐中林称,利用多项测序技术和组装算法,他们首次获得了染色体级别、完整的两套基因组序列。这标志着来自亲本的等位基因可以完整区分,为研究等位基因的功能互作提供了宝贵的数据和技术基础,具有重要的理论和应用价值。
随着西方商业猪种的普及,我国猪种受到非常大的冲击,有些著名地方品种的数量比大熊猫还要稀少,尤其在面对非洲猪瘟挑战的今天,该基因组的发布不仅为猪遗传学领域提供了关键的基准数据,而且为利用猪做模式动物研究人类健康和疾病开辟了一条新的道路。
(李 晨)