
长期以来,人类蛋白质组中约80%的靶点因结构平坦或动态性强,无法被传统药物结合,被称为“不可成药”靶点。分子胶降解剂(MGD)作为新兴疗法,可像“智能胶水”一样黏合E3泛素连接酶与致病蛋白,标记后者使其被细胞清除。然而,过去三十年仅发现不到十种有效的分子胶,且靶点识别依赖偶然性,严重制约临床转化。
MonteRosa Therapeutics公司团队利用自主开发的人工智能平台QuEEN(定量工程化新底物消除系统),结合结构生物学与蛋白质组学,首次实现对CRBN-E3连接酶潜在靶点的系统性挖掘。
研究发现,除已知的β-发夹G-loop基序外,AI首次识别出螺旋G-loop可作为CRBN结合的全新结构基序,将靶点范围扩大至人类蛋白质组中超1600种蛋白,覆盖近100种靶点类别。在自身免疫病关键靶点VAV1蛋白上,发现其通过386-390氨基酸片段与CRBN形成非经典结合,颠覆了“仅特定折叠蛋白可被降解”的传统认知。
揭示靶蛋白OFD1的K931位点SUMO化修饰可阻碍其促纤毛生成功能,而分子胶通过激活去SUMO化酶SENP1恢复其活性,为设计动态调控型疗法提供新思路。目前MonteRosa已有三条管线进入临床阶段,涵盖多发性骨髓瘤(靶向GSPT1)及炎症性疾病(靶向VAV1),预计2026年公布首批人体试验数据。
从三十年前沙利度胺的偶然疗效,到今日AI理性设计千种靶向方案,分子胶的进化史折射出技术对生命科学的颠覆性重塑。随着更多“不可成药”靶点被攻克,癌症与自身免疫病的治疗范式或将迎来全新篇章。
(彪轶辰)